Proktokolite neden olan besin besin yükleme testiyle bulunmaktadır ve daha sonra sorumlu besin ve bu besini içeren gıdalar diyete alınmaktadır. 3-6 aylık aralarda takibe alınarak yüklemeler ile düzelip düzelmediği kontrol edilmesi gerekir. Mama olarak yoğun hidrolize özel mamalar tavsiye edilmektedir. Soya bazlı mamalar ve normal mamalar tavsiye edilmemektedir. Yoğun hidrolize mamalar ile belirtiler devam edenlerde aminoasit bazlı mamalar tavsiye edilmektedir. İnek sütü diyeti yapılan anneye ve bebeğe kalsiyum ve D vitamin desteği yapılmalıdır. Sonrasında bebeğin büyüme ve gelişmesi dikkatli bir şekilde izlenmelidir.
