İnek sütü protein alerjisi olan bebeklerde; inek sütü proteini alınmasıyla mide bağırsak sisteminde inflamasyon dediğimiz iltihaplanma yapar. Bu inflamasyon özellikle kalın bağırsakta ve makatta olunca kanama eğilimi daha fazla olmaktadır. İnek sütü protein alerjisinde; özellikle; alerji testinde çıkmayan ve tip 2 alerji veya halk arasında gizli alerji dediğimiz alerji tipinde sıklıkla karşılaşırız.
Gizli alerjinin neden olduğu alerji tipinde; makat ve etrafında kızarıklık ile kendini gösteren kalın bağırsak ve makatta enflamasyonun olduğu durumda yani proktokolitte kakada kan sıklıkla görülmektedir. Kakada kan yanında sıklıkla mukus da birlikte görülmektedir. Kakada kan yanında mukuslanma yoksa inek sütü protein alerjisi dışındaki nedenler düşünülmelidir. Özellikle; makatta çatlak, makat etrafında dermatit, kan pıhtılaşma bozuklukları, K vitamini eksikliği, invajinasyon, bağırsak enfeksiyonları, rektal polip, Hirschsprung hastalığı gibi nedenler de incelenmesi gerekebilir.