İnek sütü alerjisi olan bebekte süt alerjisinin tipine göre kaka da farklı olabilmektedir. Eğer inek sütü alerjisi makatta kızarıklıkla kendini gösteren alerjik proktokolit varsa; kaka sümüklü ve bazen kanlı olur. İnek sütü alerjisi ince bağırsağı tutmuşsa ve kalın bağırsak tutulmamışsa kaka ishal şeklindedir ve gözle kan görülmese de mikroskopik olarak kan görülebilir. İnek sütü alerjisi; sadece yemek borusunu tutmuşsa kaka genelde normaldır. Bu durumda kusma ve karın ağrısı olur. İnek sütü alerjisine bağlı eozinofilik kolit durumunda da kakada mukus ve kan görülebilmektedir. Sonuç olarak; inek sütü alerjisinde kaka alerjinin etkilediği yere göre farklı olabilmektedir.