Eozinofilik özofajit belirtileri yaşa göre farklı belirtiler göstermektedir. Bebeklerde reflü belirtileri, katı gıdaları reddetme, iştahsızlık ve büyümede gerilik görülmektedir. Çocuklarda ise karın ağrısı, bulantı kusma görülmektedir. Yetişkin yaş grubunda;
-yutmakla göğüs ağrısı,
-besin yutmada takılma, bulantı, kusma, karın ağrısı, bazı gıdaların reddi, ishal ve gelişme geriliği başlıca belirtileridir. Beslenirken yemek borusunda takılma olur. Daha küçük parçalarla yemek yemek yeme, bol su içme ve et gibi katı gıdalardan kaçınma görülmektedir. Bu şikayetlerin yanında diğer alerjik hastalıklar da sıklıkla vardır. Daha çok reflü belirtilerine benzer ve reflü tedavisine yanıt olmaz.
