Çölyak hastalığı; diyabet hastalığı, tiroid hastalıkları ve bazı bağışık sistem hastalıkları ile birlikte olma eğilimi yüksektir. Bu nedenle Çölyak hastalığı olanlarda bu hastalıklar da incelenmesinde fayda vardır. Ailede Çölyak hastalığı olanlarda Çölyak hastalığı olma olasılığı da yüksektir.