Teşhis öykü ve klinik bulgularla konulmaktadır. Sorum besin yüklemesinden 48-72 saat sonra belirtiler tekrarlar. Enterokolit sendromunda ise genellikle ilk 3-4 saat içinde belirtiler ortaya çıkmaktadır. Kakada kanın görülmemesi (mikroskobik olarak görülebilir), hafifi ishal ve kusmanın olması, büyüme gelişmenin etkilenmesi gibi klinik tablo ile teşhis konulmaktadır. Eliminasyon diyetine 1 ile 3 hafta içinde cevap verir. Tekrar yükleme ve biyopsi 2 yılda bir yapılabilmektedir.
-Kakada belirgin kan yoktur. Kaka mikroskopisinde eritrosit ve lökosit görülebilir. Redüktan madde pozitifliği ve yağ pozitifliği görülebilmektedir.
-Alerji testi kandan veya ciltten yapmaya gerek yoktur. Çünkü IgE’ye bağlı değildir. Teşhis besin eliminasyon diyetine cevap ve yükleme ile belirtilerin ortaya çıkmasıyla genelde konulmaktadır.
-Klinik bulgularla teşhis konulmadığı durumlarda teşhis için endoskopi ve biyopsi gerekebilmektedir. İnce barsaktaki patolojik bulgular Çölyak hastalığında görülen bulgulara benzemektedir.
